除了政府發言人辦公室，就澳門基金會資助暨南大學校園建設一事發聲明外，澳門基金會亦就事件發聲明，表示暨南大學對澳門的人才培養，貢獻良多，針對資助，澳基會將依照監管程序對實時監管；同時，支持暨南大學的建設，實際上也是長期投資於本地人才培養的一個途徑，最終受惠的還是澳門。而暨南大學的資助，也不會影響澳基會對本地市民、社團和機構活動的繼續支持。新聞稿內容如下：
1.回歸以來，澳門基金會對四川災區和貴州、雲南、內蒙古等落後地區的建設、扶貧和教育工作都陸續提供了適當的支持，同時也與包括暨南大學在內的內地高等院校，例如北京大學、清華大學、人民大學等保持著密切的人才培養和學術合作關係。這是澳門基金會歷年來一直遵循、且在未來也不會改變的工作方向。
2.暨南大學對澳門人才培養的貢獻，可以通過以下數據說明：
1)建校以來培養了近2萬名澳門學生。至2015年11月，有1,976名澳門學生在暨南大學就讀，占澳門在內地就讀學生人數的33.7%，即每3名在中國內地就讀的澳門學生中，就有1人就讀於暨南大學；
2)1999年以來，暨南大學與澳門機構在澳門舉辦了27項教育課程，培養本地學生超過2,000名；
3)暨南大學對港澳一直執行扶持政策：在改革開放之初，暨南大學為澳門學生的就學提供了極大的便利，其中包括在90年代中期之前，該校對澳門學生一律豁免學費。即使在今天，澳門學生的學費標準也與內地學生一樣，而不按境外學生徵收。此外，在錄取方面，澳門學生還享受比內地學生更大的優惠。
4)目前，在暨南大學設立的境外獎助學金中，向澳門學生頒發的獎助學金占總人數的30%。
3.暨南大學和澳門基金會都是公立機構，均謀求公共利益，所謂利益輸送一說，純屬牽強附會。暨南大學作為一所公立高校，對境外資助款的接受、保管、使用和監管執行嚴格的規章制度；在校舍工程的報批、招投標、施工、監管、審計等各個環節有著嚴格的程序規定和措施，澳門基金會也將依照監管程序對資助款的使用進行實時監管。況且，支持暨南大學的建設，實際上也是長期投資於本地人才培養的一個途徑，最終受惠的還是澳門。
4.程序合法性方面，澳門基金會雖然優先受理和審批本地機構的資助申請，但亦有權根據章程規定，對境外機構提出的有利於澳門發展的項目予以資助。澳門基金會在收到暨南大學的資助申請後，行政委員會對文件和相關資料進行了審查並提出了資助意見，之後由信託委員會會議審議並作出決定，整個過程符合基金會資助審批的程序性規定。
5.澳門基金會作為獨立的公權法人，具有行政和財政上的自主性。雖然澳門基金會為了配合政府的預算政策，在今年對本身的開支進行了適度控制，但根據行政長官的指示，澳門基金會在本地民生、教育、社會服務等領域的投入絕未減少，2015年對澳門中小學和高等院校的校舍建設投入的資金支持就超過15億澳門元。因此，對暨南大學的資助也不會影響澳門基金會對本地市民、社團和機構活動的繼續支持。
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