《橫琴粵澳深度合作區建設總體方案》提到，合作區實施範圍為橫琴島「一線」和「二線」之間的海關監管區域，總面積約106平方公里。其中，橫琴與澳門特別行政區之間設為「一線」；橫琴與中華人民共和國關境內其他地區（以下簡稱內地）之間設為「二線」。《方案》提出，要構建與澳門一體化高水平開放的新體系，貨物「一線」放開、「二線」管住。
「一線」放開方面，對合作區與澳門之間經「一線」進出的貨物（過境合作區貨物除外）繼續實施備案管理，進一步簡化申報程序和要素。研究調整橫琴不予免（保）稅貨物清單政策，除國家法律、行政法規明確規定不予免（保）稅的貨物及物品外，其他貨物及物品免（保）稅進入。
「二線」管住方面，從合作區經「二線」進入內地的免（保）稅貨物，按照進口貨物有關規定辦理海關手續，徵收關稅和進口環節稅。對合作區內企業生產的不含進口料件或者含進口料件在合作區加工增值達到或超過30%的貨物，經「二線」進入內地免徵進口關稅。
從內地經「二線」進入合作區的有關貨物視同出口，按現行稅收政策規定實行增值稅和消費稅退稅，涉及出口關稅應稅商品的徵收出口關稅，並根據需要辦理海關手續。研究調整適用退稅政策的貨物範圍，實行負面清單管理。
另外，《方案》提到，「二線」對人員進出不作限制。（編輯部）
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